大厚度的切割是比较困难的，可不是丝架能升多高，就能切多厚。受放电加工蚀除条件的制约，后到一定程度，加工就很不稳定，直至有电流无放电的短路发生。伴随着拉孤烧伤很快会断丝，在很不稳定的加工中，切割面也会形成条条沟槽，表面质量严重破破坏。切缝里充塞着极粘稠的蚀除物，甚至是近乎于粉状的碳黑及蚀物微粒。
大厚度通常是指200mm以上的钢，至于电导率更高，导热系数更高或耐高温的其它材料还到不了200mm，如紫铜，硬质合金、纯钨、纯钼等，70mm厚就已非常困难了。
大厚度切割的主要矛盾有：
1、没有足够水的进入和交换，间隙内不能清除蚀物，不能恢复绝缘，也就无法形成放电。
2、间隙内的充塞物以电阻的形式分流了脉冲源的能量，使丝与工件间失去了足够的击穿电压和单个脉冲能量。
3、钼丝自身的载流量所限，不可能有更大的脉冲能量传递到间隙中去。
4、切缝中间部位排出蚀除物的路程太长，衰减了的火花放电已形不成足够的爆炸力，排污力。
5、材料原因，大厚度存在杂质和内应力的可能性就大为增强了。切缝的局部异常和形变机率也就大了。失去了切割冲击力，却增大了被短路的可能性。
解决大厚度切割的主要矛盾，可采取如下措施：
1、加大单个脉冲的能量(单个脉冲的电压、电流、脉宽，这三者的乘积就是单个脉冲的能量)。加大脉冲间隔，目的是钼丝载流量的平均值不增大的前题下，形成火花放电的能力，火花的爆炸力被增强。
2、选用介电系数更高，恢复绝缘能力更强，流动性和排污解力更强的冷却液。
3、大幅度提高脉冲电压，使放电间隙加大，水进入和排出也就比较容易了。
4、事先作好被切材料的予处理，如以反复锻造的办法均匀组织，清除杂质，以退火和实效处理的办法清除材料的内应力。以去除大的余理的办法使材料应力得到充分释放。
5、提高丝速，更平稳的运丝，使携水和抗据短路的能力增强。
6、人为偏制折线进给或自动进二退一的进给方式，使间隙被有效扩大。